微分方程式のパラメーター推定

すでに、質問がありますがもう少し教えて欲しいです。

下記、https://jp.mathworks.com/matlabcentral/answers/95080-#answer_104432

function dydt = samp_ode(t,y)

% x'' = -a*x'-b*x + u(t)

% a, bを実験データから推定

% 時間ｔにおける入力の実験データをINTERP1で補間

u = interp1(Time,InData,t);

% 微分方程式　

dydt = [y(2); -param(1)*y(2)-param(2)*y(1)+u];

微分方程式のところは、自分で設定するとは思うのですが、y(2)やy(1)が示している意味がわかりません。

yのデータの2番目と1番目という意味でしょうが、この場合の具体的な言意味合いがピンときません。全てy(1)ではダメなのでしょうか？